Login

Αρχές Βιολογικής Μηχανικής

Course description

 

 
General

ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΙΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΧΕΙΜΕΡΙΝΩΝ ΜΑΘΗΜΑΤΩΝ ΙΟΥΛΙΟΣ 2021. Η εξέταση του μαθήματος θα γίνει 13/7/2021 στις 4μμ στο παρακάτω link:  https://centralntua.webex.com/meet/leo

Με εκτίμηση,

Λ.Α

----

This is an introductory course for engineers with a limited background in biology that want to learn how to use their engineering knowledge to analyze biological systems. It is divided into two parts. During the fist half of the course, students will be introduced to biology (DNA, RNA, proteins, biological models) and will participate on hands-on wet lab experiments. The scope of the fist part is to provide the background of what data and problems the engineers should expect in analysing biological sysmtes. The second part is dedicated to data analysis: Introduction to Systems Biology, Data analysis & Programming, Machine learning, Supervised/unsupervised learning,   Bioinformatics. The class concludes with several applications of how systems biology is applied in drug & biomarker discovery, precision medicine, human health.

 

Online Class

Due to COVID social distancing requirements, this semester (Fall 2020) the class will take place via WEBEX. 

Conf Call details: 

Hosted by ΛΕΩΝΙΔΑΣ ΑΛΕΞΟΠΟΥΛΟΣ

Every Monday starting on Oct 12, 2020 @ 11:45 pm 

Occurs every Monday, Wednesday effective 10/12/2020 until 1/13/2021 from 11:45 PM to 3:15 AM, (UTC+03:00) Athens, Bucharest

Meeting number: 137 055 2669

Password: wVzFFCBd693

https://centralntua.webex.com/centralntua/j.php?MTID=m82e20806e3669855884a28747e31beea

 

Short Description

This is an introductory course for engineers with limited background in biological systems. It includes: Introduction to Biology, Systems Biology, wet lab techniques, Bioinformatics, and several applications in bioengineering including tissue engineering, biomechanics and medical devices

Σύντομη Περιγραφή

Το μάθημα περιλαμβάνει εισαγωγικά θέματα βιοϊατρικής μηχανικής. Περιλαμβάνει κατά 50% μαθήματα βάσης για την κατανόηση της λειτουργίας του ανθρώπινου σώματος σε επίπεδο οργάνου και κυττάρου και κατά 50% εφαρμογές της βιοϊατρικής (Συστημική Βιολογία & Βιοπληροφορική, Ιστομηχανική, Εμβιομηχανική, Βιοϋλικά, Βιοϊατρικές Κατασκευές)

Material

1ο Μάθημα. Εισαγωγή. Τι είναι Biomedical Engineering. Επαγγελματικός προσανατολισμός. Ύλη μαθήματος [YouTube link] 

2o Μάθημα. In-vivo / In-vitro Βιολογικά Μοντέλα  [YouTube link]

3o Μάθημα. DNA / RNA / Πρωτεϊνες [YouTube link]

4o Μάθημα. Πρωτεϊνες / Αντιώματα / Fluorescent Microscopy [YouTube link] 

5o Μάθημα. Systems Biology. Data Acquisition, Normalization & Visualization [YouTube link]  

6o Μάθημα. Systems Biology. Data Analysis [YouTube link]   

7o Μάθημα. Programming - Bioinformatics -I [YouTube link]    

8o Μάθημα. Programming - Bioinformatics -II [YouTube link] 

9o Μάθημα. Programming - Bioinformatics -III [YouTube link] 

10o Μάθημα. Programming - Bioinformatics -IV [YouTube link] 

11o Μάθημα. Programming - Bioinformatics -V [YouTube link] 

 

 

 

 

Βιβλιογραφία

Essential Cell Biology (ECB)

Authors: Alberts B.,Bray D.,Hopkin K.,Johnson A.,Lewis J.,Raff M.,Roberts K.,Walter P.
ISBN: 978-960-489-276-1

Ελληνικός Τίτλος: Βασικές Αρχές Κυτταρικής Βιολογίας
Τύπος: Σύγγραμμα

Υπολογιστική βιολογία

Συγγραφείς:Νικολάου, Χριστόφορος, Χουβαρδάς, Παναγιώτης
Kallipos URI: http://hdl.handle.net/11419/1577

 

Laboratory

Training for Programming in R using DataCamp - Δωρεάν Premium Access!

 

Για το μάθημα αυτό θα χρησιμοποιήσουμε την γλώσσα προγραμματισμού R και η εκμάθηση θα γίνει μέσω DataCamp.

Σε όλους τους εγγεγραμένους φοιτητές έχει σταλεί invite email για να μπούνε στο datacamp team.

Έχουν γίνει assign 6 courses σε όλο το team που θα πρέπει να ολοκληρωθούν μέχρι και 15.1.21.

Το βάρος αυτών των courses είναι 10% του τελικού βαθμού. 

Φοιτητές του μαθήματος που δεν έχουν λάβει invite email στείλτε μου email για να σας στείλω το link.

 

Methods of evaluation

Εξετάσεις

Οι εξετάσεις είναι με κλειστά βιβλία. Η ύλη παρασιάζεται αναλυτικά παρακάτω. Δεν θα σας ζητηθεί προγραμματισμός αλλά θα πρέπει να ξέρετε τι είδους μαθηματικά μοντέλα πρέπει/μπορούμε να χρησιμοποιούμε ανάλογα με τα προβλήματα, πώς πρέπει να επεξεργαζόμαστε τα δεδομένα, πώς μπορούμε να αναλύσουμε ένα βιολογικό σύστημα, τα λίγα πράγματα που είπαμε στην βιολογία και πιθανές εφαρμογές στην βιολογία και ιατρική.

Εργασίες

Όλες οι εργασίες είναι υποχρεωτικές (γραπτές και datacamp).

Αξιολόγηση

  • Οι εξετάσεις θα καλύπτουν το 50% του τελικού βαθμού.
  • Οι εργασίες καλύπτουν το υπόλοιπο 50% (40% εργασίες και 10% datacamp).
  • Διατηρώ το δικαίωμα να μεταβάλω την τελική βαθμολογία κατά +/-1 βαθμό (κυρίως βάση της συμμετοχής στην τάξη)
  • Οι εργασίες δεν ισχύουν για τις εξετάσεις του Σεπτέμβρη ούτε για επόμενα ακαδημαϊκά έτη.
  • Για φοιτητές από παλαιότερα έτη: ισχύει ότι και στο κανονικό έτος και οι εργασίες πρέπει να παραδοθούν/ξαναγίνουν.


 
Sponsored by EU